Wichtigster Streitpunkt ist die Seegrenze in der Adriabucht von Piran, wo Slowenien seien einzigen Zugang zu internationalen Gewässern beansprucht.
Nachdem Slowenien fast ein Jahr lang die EU-Beitrittsverhandlungen Kroatiens blockiert hatte, verständigten sich die Nachbarländer im Jahr 2009 darauf, ein unter Schirmherrschaft der EU-Kommission eingesetztes internationales Schiedsrichtergremium die Frage klären zu lassen.
Kroatien, das daraufhin im Jahr 2013 der EU beitrat, zog sich nach einer Verfahrensverletzung durch die slowenische Seite aus dem Verfahren zurück. Obwohl dieses in komplett internationaler Zusammensetzung neu aufgerollt wurde, blieb Zagreb bei seiner Haltung.
Slowenien wiederum droht mit einer Blockade des kroatischen Schengenbeitritts, sollte das Nachbarland nicht einlenken.